敷地の特長である斜面緑地を背景に、石垣や水景など金沢を象徴する景観を創造し、その中で鈴木大拙の世界を展開していく事を設計の基本としています。建築は、「玄関棟」「展示棟」「思索空間棟」を回廊で結ぶとともに、「玄関の庭」「水鏡の庭」「露地の庭」によって構成されています。この３つの棟と３つの庭からなる空間を回遊することによって、来館者それぞれが鈴木大拙について知り、学び、そして考える事が意図されています。夜間、「外部回廊」から「思索空間棟」にかけて足元よりの光が動線を示唆し、幻想的な空間を創り出します。